Чтобы в directvobsub сдвинуть сабы, нужно сделать 3500 кликов. Он может автоматически загружать обновлённый файл, поэтому лучше ковырять внешней программой.
Сдвигать реплики чаще всего требуется относительно трёх мест: всё, и с начала - когда перед серией есть/нет заставки телеканала; после опенинга - когда есть/нет 10 секунд рекламы; после заставки в середине - когда с ней что-то делают в разных релизах (ТВ/DVD). Тайминг анимации обычно одинаков везде (если это не блядский Евангелион, три раза перерисованный, пять раз пережатый и два раза порезанный).